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國內多位專家應邀來院作學術報告

編輯: 發表時間:2018-11-08   瀏覽次數:

2018年11月3日—11月4日,應六合彩結果 黃德雙教授的邀請,清華大學曾堅陽研究員、蘭州大學胡斌教授、華中科技大學黃勝友教授、清華大學藍勛研究員、上海交通大學涂仕奎研究員、中國科六合彩結果 數學與系統科學研究院王勇研究員、上海第十人民醫院徐輝雄教授、中科院新疆理化技術研究所尤著宏研究員、清華大學張強鋒教授、復旦大學張彥春教授、同濟大學張勇教授應邀來到六合彩結果 作學術報告,這也是計算機科學與技術系第132期智信講壇的內容。  

曾堅陽研究員的報告題目為“用于建模三維染色體結構的機器學習算法”,他對報告做了簡單介紹:解碼染色體的空間組織對研究真核生物基因調控具有至關重要的意義,并開發了一種新的流形學習為基礎的框架,叫基于構象能和多方面的學習基因組組織重構,通過與生物物理可行性集成的Hi-C數據來重建染色體的三維組織。胡斌教授的報告題目為“心理生理計算”, 并對其報告做了簡單介紹:心理生理學是研究心理或行為如何與生理學的變化相互作用,為醫學心理學的心身中介機制提供了許多基本理論依據,是醫學心理學重點基礎分支學科之一。通過將情緒活動等心理變化作為自變量,將人體各項生理反應作為因變量,提高心理學研究的可操作性和可測量性,并進一步實現從生理數據來揭示心理活動的特點和規律,最終推斷出人的心理狀態或精神狀態。黃勝友教授的報告題目為“基于分子對接的復合物結構預測和打分函數優化”,并對其報告做了簡單介紹:蛋白質和核酸是構成生命體兩類最重要的生物大分子,生命體的許多活動都由其相互作用來完成,同時,這些生物大分子相互作用又受配體如有機小分子和離子等的調控,組成生命體中復雜的分子間相互作用網絡,共同完成生命中的各項活動。序列決定結構,結構決定功能,生命活動中通過分子間相互作用所行使的功能都由其相互作用復合物結構決定,因此,確定生命體中分子間的相互作用及其復合物結構,對于理解其相互作用機制和揭示疾病的發生發展機理,從而通過對其調控來治療疾病和開發藥物有著重要的理論意義和社會價值。藍勛研究員的報告題目為“基因組預測患者對免疫療法的反應”,并對其報告做了簡單介紹:免疫療法的出現為癌癥的治療提供了曙光,并給患者帶來了令人鼓舞的臨床益處。然而,由于腫瘤和微環境的異質性高,免疫治療的療效在很大程度上取決于患者的特異性。仍然是一個嚴重的挑戰是確定免疫治療后患者生存的預測因子。我們在TCGA數據庫中對33種癌癥類型的轉錄組數據進行了轉換,以解釋由非同義突變引起的基因功能的減少,以及消除免疫細胞比例對基因活性的混雜作用。結合接受免疫治療的患者的臨床資料,我們發現四種免疫相關途徑富含基因,其表達與免疫治療后患者生存率顯著相關。涂仕奎研究員的報告題目為“聯合單核苷酸變異分析和微小核糖核酸調節的計算方法”,并對其報告做了簡單介紹:大數據已經被廣泛地生成測量各種水平的生物系統,得益于進步和測序技術降低成本。此外,所述生物數據是非常嘈雜和異質的,這使得計算分析甚至更具挑戰性。我們的實驗室一直致力于開發用于生物醫療信息的計算方法。在這次講座中,我們將首先專注于聯合個單核苷酸變異分析方法來解決“失蹤遺傳”的問題,強調了共同的基因變異可以解釋性狀和疾病,然后計算方法來了解更多的遺傳生物發生和了微小核糖核酸調節機制,通過集成多樣高通量測序數據。王勇研究員的報告題目為“數據降維的無監督特征選擇模型”,并對其報告做了簡單介紹:構建將數據維數降低、利于進一步處理、可視化和理解信息的數學模型,已成為各科學領域面對的一個共同問題。該問題在人工智能和機器學習領域也被稱為特征選擇,是一個根據一定的評估準則最優地從初始高維特征集合中選出低維特征集合的過程。我們將介紹我們最近在無監督特征選擇的一些進展,重點介紹同時最大化保持數據拓撲結構和最小化特征數目的多目標優化模型,以及用線性規劃來近似混合整數規劃獲得高效的求解算法。徐輝雄教授的報告題目為“高靈敏超聲成像及診療一體化”,并對其報告做了簡單介紹:超聲是目前臨床應用最廣泛的影像學檢查方法之一。它適用人群多,學科覆蓋面廣。同時是學科交叉的熱點,是當前研究的前沿領域。但長久以來存在的問題是:分辨率低,僅作為篩查手段使用。針對以上問題,近年來我們在臨床上圍繞一個核心,采取六大舉措,推動了超聲診療模式變革和結構轉型一個核心就是扎扎實實提高臨床水平,六大舉措就是介入化, 精準化,功能化,分子化,高頻化,智能化。第一大舉措是介入化,使超聲從一個單純的診斷工具向診療一體化轉型。尤著宏研究員的報告題目為“生物信息大數據分析、挖掘及應用研究”,并對其報告做了簡單介紹:擬結合我從事數據挖掘、大數據分析及生物信息學領域工作的理論與實踐經驗,介紹大數據的概念、生物大數據的來源、主要應用場景、及本人實驗室的研究進展闡述了生物大數據時代背景下生物信息學理論算法和應用實踐。張強鋒教授的報告題目為“RNA結構組學與計算”,并對其報告做了簡單介紹:我們實驗室在過去的幾年時間里在RNA結構組幾個方面的研究進展:1、新的實驗技術;2、新的計算方法。3、核糖核酸結構和功能關系方面進行的探索,了解核糖核酸結構在不同系統中,特別是體內基因表達調控、發育和進化,免疫反應、神經系統生成和調控以及疾病中的作用。張彥春教授的報告題目為“智慧醫療:醫學大數據挖掘及人工智能在病人監測預警及健康管理的創新應用”,并對其報告做了簡單介紹:將從全生命周期健康管理的角度出發,探討生命各階段的健康分析,人體和疾病各因素之間的關系。 通過實例介紹基于醫學數據的數據集成, 數據挖掘, 數據關聯分析及病人監測,分析預警。 應用場景將包括孕期與嬰幼兒,老年健康,手術重癥,精神健康,醫學圖像分析,腫瘤監測等應用。同學們對這一報告充滿了興趣,并有同學表示以后會嘗試做這方面的研究工作。張勇教授的報告題目為“遺傳的表觀遺傳特征引起早期胚胎發育過程中合子轉錄調控的建立”,并對其報告做了簡單介紹:建立了沿著細胞分裂過程的脫氧核糖核酸甲基化水平變化的概率模型,并將該模型應用于與合子轉錄調控的建立相關的兩個問題。在本次講座的第一部分中,我將討論遺傳性不對稱性對小鼠植入前胚胎中脫氧核糖核酸甲基化依賴性印記的貢獻。同學們對專家們的報告充滿了興趣,并有同學表示以后會嘗試做這方面的研究工作。  

曾堅陽,清華大學交叉信息研究院,研究員,博士生導師。于1999年和2002年分別獲得浙江大學的學士和碩士學位。2011年,在美國杜克大學獲得計算機科學博士學位。2011年至2012年期間,在杜克醫六合彩結果 從事博士后研究。目前主要研究方向包括計算生物學、機器學習和大規模數據分析。已在國際核心期刊和會議上發表論文50余篇。

胡斌,973首席科學家,國務院特殊津貼專家,甘肅省領軍人才,甘肅省政協委員;現任蘭州大學信息科學與工程六合彩結果 院長,瑞士蘇黎世聯邦理工六合彩結果 客座教授。教育部計算機學科教指委委員,科技委委員;國家自然科學基金委信息科學部計算機科學專家評審組成員,國際社會神經科學中國分會副主席。

黃勝友,華中科技大學物理六合彩結果 教授,1998年獲武漢大學物理學學士學位,2003年獲武漢大學理學博士學位,長期從事計算生物物理和生物信息學方面的研究,已發表SCI論文70余篇,文章累計他引2000余次。獲全國百篇優秀博士論文、中國大學生“五四”獎、湖北省自然科學一等獎等。

藍勛,2005年畢業于中國海洋大學,2012年獲俄亥俄州立大學生物醫學博士學位。畢業后先后于芝加哥大學和斯坦福大學進行博后研究。2017年起任清華大學醫六合彩結果 助理教授。在博后期間,為演化遺傳學中的重要問題之一——復制基因如何存活,提出了一個新的理論模型,即基因表達劑量均衡模型。到清華后,實驗室用計算和實驗的方法研究癌細胞演化的免疫逃避機制,以期找到個體癌癥免疫療法反應差異的原因,增強免疫細胞對癌細胞的敏感性和特異性,進一步提高免疫療法的療效。

涂仕奎,特別研究員,上海交通大學計算機科學與工程系,任電子信息與電氣工程六合彩結果 認知機器和計算健康研究中心學術秘書。2006年于北京大學獲本科學位,2012年在香港中文大學獲博士學位,2012年11月-2017年1月間,任美國麻省大學博士后,跟隨美國麻省大學醫六合彩結果 的翁志萍教授和諾貝爾獎得主克雷格梅洛教授進行研究。主要研究方向包括機器學習、生物信息學等,發表論文30余篇,頂級期刊多篇,其中在《自然》1篇,《細胞》3篇。  

王勇,中國科六合彩結果 數學與系統科學研究院應用數學所研究員, 國家優秀青年基金獲得者。1999 年從內蒙古大學數學系的數學物理專業本科學位,2002 年從大連理工大學應用數學系獲得運籌學與控制論碩士學位,2005年從中國科六合彩結果 數學與系統科學研究院獲得運籌學與控制論專業的理學博士學位。曾先后到日本大阪產業大學電子情報通信系,波士頓大學生物信息學中心, 日本產業技術綜合研究所計算生物研究中心和斯坦福大學統計系從事訪問研究。他目前的研究興趣是最優化理論與算法和生物醫學大數據建模。

徐輝雄,影像醫學及介入醫學專家。同濟大學教授、主任醫師、博士生導師。同濟大學附屬第十人民醫院副院長、同濟大學附屬第十人民醫院超聲醫學科主任、同濟大學醫六合彩結果 超聲醫學研究所所長、上海市甲狀腺疾病研究中心副主任。

尤著宏,中科院新疆理化技術研究所研究員、國科大博士生導師,國家自然科學基金優秀青年基金獲得者。2010年12月于中國科學技術大學獲模式識別博士學位;2008年6月-2009年12月在美國康奈爾大學從事聯合培養學習;2013年-2016年先后在同濟大學、香港理工大學從事博士后研究。主持或完成國家自然科學基金項目4項,博士后基金項目1項。

張強鋒,清華大學生命科學六合彩結果 、清華大學-北京大學生命聯合中心研究員,博士生導師。2000年畢業于中國科學技術大學少年班,2006年獲得中國科學技術大學計算機博士學位,2012年獲得美國哥倫比亞大學生物化學和分子生物物理博士學位。

張彥春, 澳大利亞維多利亞大學教授, 復旦大學兼職特聘教授及社會計算及電子健康實驗室主任。其研究領域包括社會計算和電子健康,大數據與數據挖掘、算法與應用研究。在這些領域發表國際期刊論文和國際學術會議文章300多篇, 其中多篇發表在國級頂級雜志和會議。

張勇,同濟大學生命科學與技術六合彩結果 教授。研究工作針對高通量生物學數據,結合生物信息學方法發展與深度數據分析,研究細胞命運決定過程中的表觀遺傳信息建立及預編程機制。獲得國家自然科學基金委優秀青年科學基金項目(2013年)、中組部“青年拔尖人才”(2015年)、中國干細胞學會“干細胞青年研究員獎”(2016年)、上海市優秀學科帶頭人(2017年)、教育部“青年長江學者”(2018年)等。 (張欽虎)

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